A Fundação S. João de Deus (FSJD) segue, em confiança e alinhamento institucional, os mesmos valores que a sua instituidora: Hospitalidade, Qualidade, Respeito, Responsabilidade e Espiritualidade.
Instituída pela Província Portuguesa da Ordem Hospitaleira de S. João de Deus (PPOHSJD) em 20 de Novembro de 2006, a FSJD é uma Instituição Particular de Solidariedade Social (IPSS), com estatuto de utilidade pública, vocacionada para o auxílio aos doentes e aos mais carenciados, dando especial enfoque aos temas da SAÚDE MENTAL.
Como Organização Não-Governamental para o Desenvolvimento (ONGD), a instituição tem como objectivo a coordenação ou apoio de diversas iniciativas – principalmente nos países em vias de desenvolvimento e subdesenvolvidos – tais como ajuda humanitária de emergência ou de calamidade pública, de reabilitação e de desenvolvimento social e comunitário.